Chemická informatika

Přednášky


Obsah

1. Úvod
1. Úvod
1.1. Chemická informatika?
1.2. Podmínky pro zápočet
1.3. Organizační informace
2. Tok informací ve vědě
1. Tok informací ve vědě
1.1. Výzkum v ideálním světě
1.2. Granty
1.3. Osobní komunikace
1.4. Konference a předběžná sdělení
1.5. Dokončení výzkumu
2. Informační exploze a kvalita publikací
2.1. Informační exploze ve vědě
2.2. Důvěryhodnost zdroje
2.3. Peer review
3. GEO-3
1. Global Environment Outlook 3
1.1. Global Environment Outlook 3
1.2. Časový pokryv
1.3. Tématické členění
1.4. Zaměření na čtenáře
4. Článek
1. Vědecké a odborné časopisy
1.1. Osnova
1.2. Získávání dat ve vědě
1.3. Články
1.4. Typy vědeckých a odborných článků
1.5. Typy vědeckých a odborných článků
1.6. Recenzní řízení (peer review)
1.7. Recenzní řízení (peer review)
1.8. Typy vědeckých a odborných časopisů
1.9. Typy vědeckých a odborných časopisů
1.10. Specializace časopisů
1.11. Cena primární literatury
1.12. Cvičení - články
1.13. Cvičení - knihy
2. CASSI
2.1. Cvičení - CASSI
2.2. Cvičení - Ulrich's Periodicals Directory
5. Identifikátory
1. Identifikátory knih, časopisů, jednotlivých publikací
1.1. Identifikátory publikací
1.2. ISBN - základní fakta
1.3. ISBN kód
1.4. ISSN
1.5. ISSN kód
1.6. DOI
1.7. Identifikátory - cvičení
6. Booleova algebra
1. Booleova algebra, textové operátory
1.1. Poctivci a padouši
1.2. Operátory používané při sestavování dotazů
1.3. Logické operátory
1.4. Booleova algebra
1.5. Cvičení - odstraňte závorky
1.6. Cvičení - vyhodnoťte výrazy
1.7. Proximitní operátory
1.8. Rozšiřování výrazů
1.9. Příklady:
1.10. Další pojmy
7. Internet
1. Internet - historie
1.1. Vznik Internetu
1.2. Vývoj internetu v grafech
2. Internet - IP adresy, domény
2.1. Co je IP adresa?
2.2. Co je doména?
3. Internetové vyhledávače (Google)
3.1. Pokročilé vyhledávání
3.2. Cvičení
3.3. Služby vhodné pro vyhledávání vědeckých informací
4. E-mail
4.1. Jak psát a nepsat e-maily
8. Web of Science (Science Citation Index)
1. Citační praxe primárních publikací. Science Citation Index
1.1. Citační praxe primárních publikací
1.2. Citační praxe primárních publikací
1.3. Obvyklý způsob citace
1.4. Vzájemné citování - informační hodnota
1.5. Science Citation Index
1.6. Citovanost - kritérium pro hodnocení
2. Web of Science - elektronický Science Citation Index
2.1. Elektronická báze - obsah a umístění
2.2. Základní pojmy
2.3. Cvičení
2.4. Cvičení - JCR
2.5. Elektronická báze - typ hledání
2.6. Easy Search - výběr databáze
2.7. Easy Search - hledání podle předmětu
2.8. Seznam nalezených článků
2.9. Plný záznam
2.10. Citující články
2.11. Easy Search - hledání podle autora
2.12. Easy Search - hledání podle autora
2.13. Easy Search - výsledek hledání podle autora
2.14. Easy Search - hledání citujících prací
2.15. Easy Search - hledání článků o osobě
2.16. Easy Search - výsledek článků o osobě
2.17. Easy Search - hledání článků podle místa
2.18. Full Search
2.19. Full Search - výběr pokrytí
2.20. Full Search - obecné hledání
2.21. Full Search - výsledek obecného hledání
2.22. Full Search - hledání podle citací
2.23. Full Search - sestavení seznamu "odkazovaných" článků
2.24. Full Search - hledání podle citací
2.25. Full Search - výsledek hledání podle citací
2.26. Cvičení
9. Struktura sloučeniny
1. Struktura chemické sloučeniny a její informační využití
1.1. Názvosloví
1.2. Lineární reprezentace struktury chemických sloučenin
1.3. Lineární reprezentace struktury chemických sloučenin
1.4. Topologický popis struktury - použití spojovacích tabulek
1.5. Redundantní spojovací tabulka
1.6. Redundantní spojovací tabulka
1.7. Neredundantní spojovací tabulka
1.8. Využití spojovacích tabulek
1.9. Strukturní báze dat a jejich využívání
1.10. Strukturní báze dat a jejich využívání
1.11. Reakční báze
1.12. Hledání ve strukturních bázích
1.13. Hledání ve strukturních bázích
1.14. Zadávání struktury
1.15. Strukturní editor ISIS Draw
1.16. Vztah struktury - název - identifikátor
1.17. Cvičení - kreslení strukturních vzorců
1.18. Cvičení - opakování
10. Historie CA
1. Historie Chemical Abstracts
1.1. Chemical abstracts
1.2. Chemical Abstract Service (CAS)
1.3. Zpracovávané publikace
1.4. Další služby CAS
1.5. Zastoupení oborů v CA
1.6. Jazyk
1.7. Systém zpracování informací v CAS
1.8. “Ruční zpracování”
1.9. Způsob práce v CAS
1.10. Nová sekundární informace
1.11. Možnosti využití
1.12. Realizace
1.13. Chronologické pokrytí
11. CA compounds
1. Nomenklatura CA
1.1. Nomenklatura
1.2. Nomenklatura - vyjímky
1.3. Způsob hledání správného názvu v CA
1.4. Zpřehlednění Substance Index
1.5. Příklady
1.6. Categories
1.7. Složitost názvosloví
1.8. Složitost názvosloví
1.9. Základní pravidla CAS nomenklatury
1.10. Základní pravidla CAS nomenklatury
1.11. Pořadí pod "parentem"
1.12. Soli
1.13. Pomoc při hledání názvu chemické sloučeniny
2. Registrační systém CA
2.1. Registrační systém CA
2.2. Registrační systém CA
2.3. Registrační systém
3. CA Formula Index
3.1. Formula Index (vzorcový)
3.2. Příklady
3.3. Formula Index
3.4. Způsob indexování
12. Chemical Abstracts
1. Jak hledat v CA
1.1. Hledání v CA - podle předmětu
1.2. Hledání v CA - podle látky
1.3. Hledání v CA - podle autora
1.4. Jak hledat v CA - postup
1.5. Hledání v CA - cvičení
1.6. Cvičení
1.7. Cvičení
2. Detailní rozbor abstraktu
2.1. CA Heading
2.2. Text abstraktu
2.3. Heading - sériové publikace
2.4. Heading - sériové publikace
2.5. Heading - proceedings and edited collections
2.6. Heading - technical reports
2.7. Heading - dissertation
2.8. Heading - books and audio-visual materials announcements
2.9. Heading - patent
13. Chemical Abstracts - popis tištěných verzí (starší, nekrácená verze)
1. Chemical Abstracts
1.1. Chemical abstracts
1.2. Osnova
1.3. CA v ÚK VŠCHT
1.4. Třídění abstraktů - sekce
1.5. Sekce
1.6. Zkratky
1.7. Tištěná forma CA
1.8. Tištěná forma CA
1.9. Rejstříky
1.10. Rejstříky pomocné
1.11. Dělení rejstříků
1.12. Kumulované rejstříky
1.13. Rejstříky pomocné
1.14. Keyword Index
1.15. Author Index - Issue Indexes
1.16. Author Index - Issue Indexes
1.17. Author Index - Issue Indexes
1.18. Author Index - Volume and Collective Indexes
1.19. Příklady
1.20. Řazení jmen
1.21. Předmětové rejstříky (Subject Indexes)
1.22. General Subject Index
1.23. General Subject Index
1.24. General Subject Index obsahuje:
1.25. Chemical Substance Index
1.26. Patent Index
1.27. Index Guide
1.28. Index Guide
1.29. Index of Ring System - Handbook of Ring Systems
1.30. Zápis kruhového systému
1.31. Příklad zápisu kruhového systému
1.32. Registry Handbook
1.33. Chemical Abstracts Service Source Index (CASSI)
1.34. Souhrnné rejstříky (Collective Indexes)
1.35. Dodatky k názvosloví CA (pro tištěnou verzi)
14. Beilstein
1. Beilstein - historie
1.1. Beilsteins Handbuch der organischen Chemie
1.2. Proč hledat v Beilsteinu
1.3. Historie
1.4. Současnost
1.5. Crossfire
2. Beilstein - cvičení
15. Gmelin
1. Gmelin - historie
1.1. Počátek
1.2. Současná forma
1.3. Crossfire
16. Ullmann
1. Ullmannova encyklopedie - historie
1.1. Ullmann’s Encyklopedie der technischen Chemie
1.2. Ullmann’s Encyklopedie der technischen Chemie
2. Ullmannova encyklopedie - elektronická verze
2.1. Ullmann´s Encyclopedia of Industrial Chemistry
2.2. Výhody elektronické verze oproti tištěné
2.3. Seznam článků
2.4. Předmětový rejstřík
2.5. Seznam autorů
2.6. Hledání podle CAS RN
2.7. Hledání - full-text
2.8. Obsah článků
2.9. Cvičení
17. Kirk-Othmer
1. Ullmannova encyklopedie - historie
1.1. Kirk-Othmer Encyclopedia of Chemical Technology
1.2. Kirk-Othmer Encyclopedia of Chemical Technology
2. Kirk-Othmer - elektronická verze
2.1. Kirk-Othmer Encyclopedia of Chemical Technology
18. Další sbírky dat a encyklopedie
1. Další sbírky dat a encyklopedie
1.1. Další encyklopedie
1.2. Další encyklopedie
1.3. Reakce a syntézy
1.4. Sbírky dat ("Data Collections") - analytické metody
1.5. Sbírky dat ("Data Collections") - hazard
19. Handbook of Chemistry and Physics
1. Handbook of Chemistry and Physics
1.1. Handbook of Chemistry and Physics
1.2. Vyhledávání
1.3. Cvičení
20. NIST Webbook
1. NIST Webbook
1.1. NIST Webbook
1.2. Volba typu hledání
1.3. Hledání podle sumárního vzorce
1.4. Výsledek hledání - více sloučenin
1.5. Detaily o sloučenině
1.6. Detaily - příklad I: termochemická data plynné fáze
1.7. Detaily - příklad II: data fázové přeměny
1.8. Podle čeho lze ještě vyhledávat - obecné
1.9. Podle čeho lze ještě vyhledávat - fyzikální vlastností
1.10. Cvičení
21. MSDS
1. MSDS
1.1. MSDS
1.2. Možnosti zadávání dotazu
1.3. Hledání podle části chemického názvu
1.4. Hledání podle přesného chemického názvu
1.5. Hledání podle CAS RN
1.6. Cvičení - toxikologické informace
22. MEDLINE
1. EBSCO, MEDLINE
1.1. EBSCO
1.2. MEDLINE
1.3. Příklad vyhledávání
1.4. Články týkající se dioxinů
1.5. Časopisy týkající se toxikologie
1.6. Složitější dotaz
23. MICROMEDEX
1. MicroMedex
1.1. MICROMEDEX Integrated Search
1.2. MICROMEDEX Integrated Search II
1.3. MICROMEDEX Integrated Search III
1.4. Podle čeho lze ještě vyhledávat:
1.5. MICROMEDEX - ChemKnowledge
24. Patenty
1. Patentové informace
1.1. Patentové informace
1.2. Patentovat lze téměř vše
1.3. Popis patentu
1.4. Průmyslová práva
1.5. Historie
1.6. Současnost u nás
1.7. Patentové úřady
1.8. Jazyk a působnost patentu
1.9. Udělování patentu
1.10. Přihláška patentu
1.11. Udělení/neudělení patentu
1.12. Patentový průzkum
1.13. Patentové třídění
1.14. Patentové třídění
1.15. Sekce
1.16. Sekce
1.17. Sekce
1.18. Možnost vyhledávání patentů - patentové rešerše
1.19. Způsoby provádění patentových rešerší
1.20. Patenty a Chemical Abstracts
1.21. Další patentové služby
1.22. Společnost DERWENT
1.23. Společnost DERWENT
1.24. Způsob vyhledávání
1.25. Cvičení - patenty
1.26. Cvičení - ochranné známky
25. Publikování
1. Datové publikační formáty
1.1. Texty
1.2. Datový formát umožňující i sémantický popis: XML
1.3. Grafika
1.4. Cvičení
2. Způsob a forma publikování
2.1. Současná forma publikování
2.2. Problém stažení článku
3. Preprint servery
3.1. Co je preprint?
3.2. Výhody preprintu
3.3. Problémy preprintu
3.4. Otázky kolem preprint serverů
26. Informatics, bioinformatics, classical informatics
1. Informatics
1.1. Informatika
1.2. Bioinformatika
1.3. Bioinformatika - předměty zájmu
1.4. Bioinformatika - předměty zájmu
1.5. Chemická Informatika
1.6. Významné časopisy
27. Normy
1. Normy
1.1. Cvičení - třídění norem
A. Zřízení webové stránky
1. Webhosting
1.1. Webzdarma - registrace 1
1.2. Webzdarma - registrace 2
1.3. Webzdarma - registrace 3
1.4. Přenos dat
1.5. Quick
1.6. Volny.cz
1.7. Sweb - registrace a vytvoření prezentace
1.8. Sweb - přenos dat
Slovník
Rejstřík

Seznam obrázků

8.1. Základní pojmy
8.2. Vstupní stránka
8.3. Výběr databáze
8.4. Hledání předmětu - zadání dotazu, nastavení řazení
8.5. Seznam nalezených článků
8.6. Plný záznam
8.7. Citující články
8.8.
16.1. Ullmannova encyklopedie on-line
16.2. Ullmann - seznam článků
16.3. Ullmann - seznam hlavních kategorií
16.4. Ullmann - podkategorie "Gas Chromatography"
16.5. Ullmann - seznam autorů
16.6. Hledání podle CAS RN
16.7. Hledání podle CAS RN - seznam článků
16.8. Hledání podle CAS RN - ukázka článku
16.9. Hledání - full text
16.10. Hledání - full text - seznam článků
16.11. Hledání - full text - ukázka článku
16.12. Ukázka textu s hypertextovými odkazy
16.13. Ukázka schématu
19.1. Handbook of Chemistry and Physics on-line
19.2. Vyhledávání v HBCP - volba pole
19.3. Vyhledávání v HBCP - zadání hodnoty
19.4. Vyhledávání v HBCP - výsledný seznam dokumentů
20.1. Vstupní stránka
20.2. Volba typu hledání
20.3. Zadávání sumárního vzorce
20.4. Výsledek hledání - více sloučenin
20.5. Detaily o sloučenině
20.6. Termochemická data plynné fáze
20.7. Data fázové přeměny
20.8. Data fázové přeměny - výparná entalpie
21.1. Hledání podle části chemického názvu
21.2. Hledání podle části chemického názvu - seznam sloučenin
21.3. Hledání podle přesného chemického názvu
21.4. Hledání podle přesného chemického názvu - seznam sloučenin
21.5. Formát zobrazení
21.6. Formát zobrazení
21.7. Formát zobrazení
21.8. Hledání podle CAS RN
21.9. Hledání podle CAS RN - seznam sloučenin
22.1. Vstupní stránka
22.2. Hledání v sekci Keyword
22.3. Hledání v sekci Keyword. Výsledek - seznam článků
22.4. Hledání v sekci Keyword. Ukázka abstraktu.
22.5. Sekce Publications - prohlížení typu "Alphabetical" (abecední)
22.6. Sekce Publications - prohlížení typu "Relevancy Ranked" (podle relevance)
22.7. Složitější dotaz
22.8. Složitější dotaz - výsledek hledání
23.1. Vstupní stránka
23.2. Seznam relevantních odkazů
23.3. Odkazy do jednotlivých databází pro zvolenou sloučeninu
23.4. Ukázka dokumentu z konkrétní databáze
23.5. ChemKnowledge Free-Text Search - zadání dotazu
23.6. Seznam relevantních abstraktů
25.1. Ukázka obrázku typu 'bitmapa'